闽江马尾对台综合客运码头位于琅岐岛西北侧三平南兜岸段，共建3个泊位（其中1为5000吨级客货泊位），设计年货物通过能力25.2万吨，年旅客通过能力56.4万人次。
该码头开放后，两马航线通航单程时间将缩短近一半。也就是说，目前从马尾港到马祖需要90分钟，今后从琅岐到马祖，只要45分钟左右。码头预计2018年底建成。届时，福州市民经快速通道到琅岐搭船去马祖，耗时和花费都将大幅下降，并可经马祖前往台湾岛内多个城市。
目前码头三个泊位已经完成工程量百分之七十以上，客运大楼正在加紧建设之中，预计八月份可以竣工。
客运大楼建设工地
